Le DNA polimerasi sono in grado di aggiungere nucleotidi al filamento solo se i nucleotidi già inseriti sono appaiati correttamente ai loro nucleotidi complementari sul filamento stampo; se si verifica un errore questi enzimi invertono la loro direzione di marcia rimuovendo i nucleotidi fino a quando incontrano un nucleotide appaiato in modo corretto, a questo punto iniziano nuovamente a muoversi in avanti aggiungendo nucleotidi.
Quindi, il proofreading è la capacità di leggere le sequenze e di rimuovere i nucleotidi.
Esistono vari meccanismi per riparare:
- riparazione diretta, l'enzima rimuove il gruppo alchilico;
- riparazione per escissione di nucleotidi: eliminazione e sostituzione del tratto di DNA con la sequenza corretta.
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